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根据《民法典》第一百五十二条 有下列情形之一的,撤销权消灭:(一)当事人自知道或者应当知道撤销事由之日起一年内、重大误解的当事人自知道或者应当知道撤销事由之日起九十日内没有行使撤销权;(二)当事人受胁迫,自胁迫行为终止之日起一年内没有行使撤销权;(三)当事人知道撤销事由后明确表示或者以自己的行为表明放弃撤销权。当事人自民事法律行为发生之日起五年内没有行使撤销权的,撤销权消灭。针对您描述的问题,您基于重大误解或者处于危困状态、缺乏判断力等情形下作出显失公平的行为,可以尝试申请法院撤销协议,再申请工伤认定,但是涉及到除斥期间以及工伤认定时限的问题,如果您在一年之内,建议您抓紧时间申请认定并起诉撤销协议。
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